在三都港之口，故名。1958年成立大队，1 984年改为村委会。村位于三都岛南部，在镇区东0.8公里，港口山东南侧。村委会驻涵头村，辖涵头、刘厝、麻洋、塘乾头、大垄头、牛头里、樟柴湾、户岐、半山、过坪、曾厝里、塘边、钱斗湾、加垄坪、外垄、里垄、扑底等15个自然村，其中涵头村、刘厝里、塘边村、扑底村四村已连为一片居住区。设11个村民小组，654户，2419人。本村籍大学学历9人，其中博士后1人（周代星，马里兰大学生物学博士，杜克大学博士后，现居住于美国加洲，中国北京大学分子医药研究所高级顾问）。耕地1300亩，林地6662亩。种植业产稻谷、甘薯、蔬菜。有村委楼、校舍、船坞各一处；古建筑有宫、寺庙各一座；有百年修道院遗址一处。村内港口塘围垦于1970年，面积1500亩，可耕地1300亩，堤长1.26公里，高5.2米。村内有驻军数家单位。通电、电话、电视，通水泥路。

　　港口村与松岐村、寒垅村、斗帽村、黄湾村、大湾村、鸡公山村、城街村、礁头村、礁溪村、城里村、白匏村、介溪村、海上社区、孟澳村相邻。

　　2020年12月，港口村入选2019年度福建省“一村一品”示范村名单（大黄鱼）。

　　港口村附近有三都澳斗姆风景区、三都近代建筑群、支提山、宁德东湖水利风景区、霍童古镇等旅游景点，有天山绿茶、蕉城晚熟龙眼、三都澳晚熟荔枝、天山红、宁德缢蛏等特产。